К сожалению, архивы сохранили очень мало сведений о внутренней жизни Кассианова Учемского монастыря. Здесь мы приводим список, составленный Олегом Борисовичем Карсаковым, сотрудником Мышкинского народного музея и опубликованный в переизданной книге П. В. Василевского «Преподобный Кассиан Грек Угличский чудотворец и основанная им Учемская пустынь». Издание народного музея. Мышкин 1997.
1. Гавриил (1482) – игумен Учемский. Был на освящении собора Угличского покровского монастыря.
2. Святой Кассиан (1489 – 4 окт. Ст. стиля 1504_ - строитель
3. Илларион (1504) - священноинок, «поставлен Преподобным Кассианом на место себя (…) пастырем и начальником».
4. Пахомий (1522) – игумен. При нем была подтверждена жалованная данная обельно-несудимая заповедная и двусрочная грамота Василием III на деревни Туханово, Модявино и другие, починки и пустоши в Городском стане Угличского уезда.
5. Иона (1543) – игумен
6. Закхей (1543) – игумен. Упоминается как «знаток» межи между владениями Спасского монастыря и землями князя Ф.М. Мстиславского.
7. Корнилий (XVI в.) – игумен.
8. Макарий (XVI в.) – игумен.
9. Порфирий (1560) – игумен. В.О. Ключевский считал его составителем жития Кассиана Учемского
10. Серапион (конец XVI в.) – игумен.
11. Феодосий (1609) – игумен. Его имя встречаем в нескольких «чудесах Преподобного Кассиана», восходящих к первому десятилетию XVII века и периоду смутного времени. Как пишет А. А. Титов, «из других источников известно», что игумен Феодосий с частью братии был замучен поляками, которые допытывались у него о монастырских сокровищах.
12. Васиан (нач. XVII века) – игумен
13. Арсений (1620-1624) – игумен
14. Васиан (нач. XVII века) – игумен
15. Никандр (1631) – игумен.
16. Филарет (первая половина XVII века)
17. Гермоген (Ермоген) (до 1659 г.) – игумен. Упоминается в «Чудесах Преподобного Кассиана» как автор первого известного нам словесного портрета Прп. Кассиана, запечатленного на «хартице».
18. Киприан (1659 – 67, 69 (?)– игумен. При нем употребляется село Мышкино (будущий город) как центр рыбной торговли в округе.
19. Давид (16701678) – игумен.
20. Филипп (конец XVII в.) – игумен.
21. Ефрем (конец XVII в.) – игумен
22. Иона (1686-1705) – игумен. При нем Учемский монастырь произвел несколько выгодных земельных операций по обмену пустошами и пашней, положено начало строительным работам, пополнился новыми книгами для монастырской библиотеки, в том числе при Ионе особенно целенаправленно продолжалась работа по дооформлению Учемского синодика.
23. Моисей (1705 – 1721) – игумен. Пр нем была построена Успенская Соборная церкочь.
24. Афанасий (1712 – 1714) - игумен.
25. Киприан (1716 – 1723) – игумен.
26. Питирим (1724) – игумен. В Учемском синодике записан с прозванием «Новгородец». В 1724 году Питирим пытается выполнить указ епископа Ростовского и Ярославского Георгия по приписанию Моложского Афанасьевского монастыря к Кассианову Учемскому. Это, видимо, последний яркий эпизод расцвета Учемского монастыря в начале XVII столетия.
27. Симеон (20-е года XVIII в.) – игумен.
28. Макарий (20-е года XVIII в.) – игумен.
29. Гедеон (до 1729) – игумен. В Учемском синодике упоминается с прозванием «Гронский»
30. Иоасаф (1729 – 1730) – игумен.
31. Гурий (до 1734 г.) – игумен. В Учемском синодике упоминается с прозванием «Муромец»
32. Иоанникий (1734 – 1742) – игумен.
33. Герасим (1743 – 1745) – игумен.
34. Филарет (сер. XVIII в) – игумен.
35. Тихон (1747) – игумен
36. Иоаким (сер. XVIII в.) – игумен. В Учемском синодике упоминается с прозванием «Учемский».
37. Иосиф (1754) - игумен.
38. Дмитрий (после 1754 г.) – игумен.
39. Иоаннуарий (1757 – 1759) – игумен.
40. Мисаил (1760 – 1763) – игумен.
41. Иосиф (1763 – 1764) - игумен.